Wpływ zmiany pojedynczego aminokwasu w cząsteczkach MHC klasy I na tempo progresji do AIDS cd

Względne zagrożenia progresji 1,71 dla pacjentów z pojedynczą kopią i 5,23 dla pacjentów z dwiema kopiami dowolnego allelu HLA-B * 35 były znaczące (Figura 1). Jednakże nie zaobserwowano wpływu alleli HLA-B * 35 u czarnych, chociaż brak efektu homozygotyczności dla HLA-B * 35 w tej grupie rasowej jest niejednoznaczny, ponieważ próbka obejmowała tylko dwóch pacjentów, którzy byli homozygotyczni dla HLA-B * 35. Stowarzyszenie HLA-B * 35 Podtypy z progresją do AIDS
Tabela 1. Tabela 1. Różnice w miejscach wiązania peptydów i motywach HLA-B * 35 Wykrywane podtypy u pacjentów z AIDS i ich wpływ na progresję do AIDS. Tylko jeden podtyp HLA-Cw * 04 (HLA-Cw * 0401) był obecny zarówno w białych, jak i czarnych kohortach. Z drugiej strony u naszych pacjentów było pięć alleli HLA-B * 35; kodują produkty różniące się od siebie nie więcej niż trzema aminokwasami w całej cząsteczce HLA (tabela 1). Skład aminokwasowy kieszeni P2, który rozpoznaje peptydy, które mają prolinę (P) w drugiej pozycji (P2), jest identyczny we wszystkich tych cząsteczkach HLA-B * 35. Jednakże, skład aminokwasowy kieszeni P9 zmienia się w różnych podtypach HLA-B * 35, co odpowiada zmianie preferencji aminokwasów na końcu karboksylowym prezentowanego peptydu.
Uwzględniliśmy allel HLA-B * 53 w naszej analizie podtypów HLA-B * 35 z kilku powodów. Po pierwsze, HLA-B * 5301 jest filogenetycznie blisko spokrewniony z grupą allela HLA-B * 35 i prawdopodobnie pochodzi z konwersji pojedynczego genu w sekwencji kodującej kieszeń P9 prekursora HLA-B * 35. HLA-B * 5301 wiąże się specyficznie z proliną przy P2 i niespecyficznie na końcu karboksylowym (P9); te swoistości są podobne, ale nie identyczne z tymi dla innych podtypów HLA-B * 35 (tabela 1). Po trzecie, czarni uczestnicy niosący jedną lub dwie kopie allelu HLA-B * 53, u których HLA-B * 5301 ma stosunkowo wysoką częstotliwość (12,3 procent), wykazali istotną predyspozycję do szybkiego postępu w AIDS (względne zagrożenie, 2.11; 95-procentowy przedział ufności, 1,13 do 3,95; P = 0,02).
Podtypy HLA-B * 35 i B * 53 dzielą się na dwie ogólne grupy na podstawie preferencji wiązania peptydów: te, które wiążą peptydy zawierające prolinę w pozycji P2, ale które nie wykazują preferencji dla konkretnego aminokwasu w P9, które są nazywany grupą HLA-B * 35-Px (P oznacza prolinę, a x oznacza brak pojedynczej preferencji, do grupy należą HLA-B * 3502, B * 3503, B * 3504 i B * 5301); oraz te, które wiążą peptydy zawierające prolinę w pozycji P2 i tyrozynę w pozycji P9, które są określane jako grupa HLA-B * 35-PY (P oznacza prolinę, a Y oznacza tyrozynę, do grupy należą HLA-B * 3501 i B * 3508) (tabela 1). Analizy przeżycia w odniesieniu do progresji do AIDS (zgodnie z definicją CDC z 1987 roku) 24 przeprowadzono indywidualnie dla wszystkich podtypów HLA-B * 35 (plus HLA-B * 5301) w celu sprawdzenia, czy zmienność wśród podtypów może wpływać na szybkość przejście do AIDS (Tabela 1).
Ryc. 2. Ryc. 2. Analiza przeżycia pod wpływem HLA-B * 35 Podtypy dotyczące przeżycia wolnego od AIDS (według definicji CDC z 1987 r.) U pacjentów z jedną kopią allelu HLA-B * 35-PY (B * 3501 lub B * 3508) (niebieska krzywa) w porównaniu z pacjentami z jedną kopią allelu HLA-B * 35-Px (B * 3502, B * 3503, B * 3504 lub B * 5301) (czerwona krzywa) i pacjentów bez alleli HLA-B * 35 lub HLA-B * 53 (czarna krzywa)
[hasła pokrewne: ortodoncja gliwice, promazyna, ksobne ]
[więcej w: oberwanie brzucha objawy, gruźlica prosówkowa, renta na nerwice ]